Spekulationer runt CR/CB genetik

Räkor Allmänt
1

Får se hur mycket jag hinner skriva på detta nu (har en marängtårta som ska dekoreras…) men får komplettera senare isåfall.
Disclaimer 1: Detta kanske har avhandlats tidigare, isåfall ber jag om ursäkt för upprepning.
Disclaimer 2: Jag skriver detta mest för att strukturera upp mina spekulationer och för att jag önskar input från folk med andra teorier eller egna erfarenheter.

Vad jag har förstått så är Crystal Red (CR) och Crystal Black (CB) två färgmorfer av samma räkart (Caridina cantonensis). Förutsatt att räkorna är diploida, dvs har två genuppsättningar -en uppsättning nedärvd från vardera förälder, och inte polyploida (en snabb googling av “Cardina shrimp” + “ploidy” gav inga resultat, får kolla Google Schoolar/andra databaser senare. Om inte någon annan här kan informera? Jag erkänner att jag inte sökt på engelska räksidor) så har vi det enklaste skolboksexemplet av genetic á la Mendel.

Räkorna har två uppsättningar av alla gener och i de celler där de uttrycks får vi svart eller röd pigmentering. Den allelen (genvarianten) som ger upphov till svart pigmentering är dominant gentemot den recessiva allelen som ger upphov till röd pigmentering. Och det verkar som att det är allmänt accepterat att det är just ett locus (en gen) som ger upphov till pigmenteringen (Jfr bruna eller blå ögon hos människor).

En räka kan då antingen ha dubbel uppsättning av alleler för svart (SS) eller rött (RR) pigment (dvs homozygoter för svart eller rött) eller ha en svart och en röd allel (SR = heterozygot, dvs olika pigmentuppsättningar). Jag vet att man konventionellt använder versaler för dominant allel och gemener för recessiv allel, men jag har ostrukturerade tankar i huvudet som vill utveckla detta vidare och tänker spara eventuellt bruk av gemener till senare.

I enkla korsningsscheman får man då att av 2räkor som båda är SS (respektive RR) så får man avkomma som precis som föräldrarna har dubbel uppsättning av respektive allel. Korsar man SS med RR så kommer första generationen avkomma att alla vara SR. De kommer alla att se svarta ut men bär på anlaget för röd pigmentering.

(Parentes: Undrar om den röda genen uttrycks men att produkten maskeras av det svarta pigmentet -som det gör i vissa fall, eller om ena genuppsättningen inaktiveras -som det också kan göra.)

Iallafall, korsar man SR med SR så får man (teoretiskt):
SR X SR = SS, 2x SR, RR
Dvs. 75% som ser svarta ut, varav 2/3 av dessa svarta bär på röd allel, och 25% som ser röda ut.

Fundering 1: Jag tycker att en del CB ser mer bruna än svarta ut. Självklart påverkas räkor av miljön runt om dem (bla vattenkvalitén). Ni kanske har råkat ut för räkor som efter ett tag inte har samma färg som de hade vid inköp, att de ändrat färg vid drastiska vattenbyten eller vid byte av foder etc. Har även läst att deras färg och/eller färgintensitet kan ändras flera gånger under deras liv. Detta tyder på att färgintensiteten delvis beror på en genetisk faktor (främst nedärvd förmåga) men även på plasticitet (en egenskap som är en slags individuell anpassningfärmåga och som, även om den till viss del är nedärvd, till större delen beror på annat än nedärvda gener).

Men om man nu skulle anta att den bruna färgen är genetisk så:
Spekulation 1: (to be continued…)

2

Men om man nu skulle anta att den bruna färgen är genetisk så…
Spekulation 1 - Om brun färg enbart beror på en fungerande uppsättning av genen:
Brunt (s) skulle kunna vara en muterad variant av den svarta allelen (S). En mutationsförändring som resulterar i en annan aminosyra så att pigmentmolekylen får en annan form (vilket får molekylen att reflektera ljus i bruna våglängder istället för att absorbera ljus i alla våglängder). En mutation skulle också kunna orsaka att inte hela genen uttrycks, vilket också resulterar i att andra våglängder av ljus reflekteras i jämförelse med de våglängder som den omuterade varianten gör, antingen direkt (pga molekylens kortare längd) eller indirekt (genom att molekylens struktur förändrats med dess längd).
(Jfr blå ögonfärg hos människor: det är små mutationer i allelen som kodar för blå ögonfärg som gett upphov till de många olika nyanserna av blått (ljust, mörkt, grått, grönt etc.)
Isåfall skulle heterozygota sR uppfattas som bruna, i jämförelse med heterozygota SR. Likaså med homozygota ss, i jämförelse med homozygota SS. Medan det däremot inte skulle vara någon skillnad mellan SS och Ss, eftersom det räcker med en fungerande allel och muterade alleler oftast är recessiva gentemot de ursprungliga allelerna.

Spekulation 2 - Om brun färg beror på två fungerande genuppsättningar:
Räkan behöver två fungerande genuppsättningar där båda alleler kodar för svart (SS), för att uppfattas som svart. Heterozygota räkor (SR) skulle då uppfattas som bruna, eftersom mängden svart pigment som producerats inte helt maskerar det röda pigmentet som också producerats och som lyser igenom.
Fast då är frågan om avsaknaden av rött pigment, pga en defekt allel (r) i en heterozygot Sr skulle ge upphov till svart räka ("mängd"fråga…) eller om den skulle uppfattas sin blaskigt mörk (…"relativ mängd"fråga).

Hur ser ni det? Ni som har erfarenhet av CR ihop med CB, har ni märkt någon skillnad åt det ena eller andra hållet?
Jag spekulerar bara teoretiskt, det vore roligt att få ta del av folks erfarenheter (något som inte jag har)!
.oO Så detta inte enbart blir en monolog eller min ranson av söndagssvammel Oo.

3

Genetik är inte min starka sida, och helt ärligt orkade jag inte läsa allt du skrivit om ämnet även om det säkert är intressant för många.

Min erfarenhet av att ha Crystal red och black ihop är att crystal black inte blir kolsvarta i det svarta så att säga utan helt riktigt blir allt från brunt till “brunsvart”. Riktigt kolsvarta CB är det väldigt svåra att hitta och då nästan bara i de så kallade “PBL” Pure black line.

De här PBL är odlade under många generationer och aldrig beblandade med vare sig CR eller Snowhites.

Skulle man i dag separera sina CR från CB vilket jag gjort för ett par år sedan, skulle jag gissa på att det tar bra många generationer till innan CB skulle va riktigt svarta igen. Det hade så klart också krävt extremt hård gallring i varje generation där alla brunfärgade CB skulle tagas åt sidan till egna kar.

Lite tankar och erfarenhet från mig…